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关于杨梅叶绿体基因组测序及数据个性化分析的招标公告
来源:东山中心   作者:   发布时间:2019年11月13日 10:44   查看次数:


为实施2019年苏州市杨梅种质资源保护项目,就其所需要的杨梅叶绿体基因组测序服务进行招标采购。欢迎符合采购文件资格条件的供应商前来参加。

一、 采购内容:杨梅叶绿体基因组测序及及数据个性化分析

二、 采购预算:人民币拾捌万元整(¥180000.00

三、 采购需求

(一)项目概述

单位建设的杨梅种质资源圃收集了国内外杨梅品种120余个,其中苏州地方品种(系)30多个,积累了大量的杨梅种质资源特性资料,并就地保存了杨梅优异种质资源20余份。为分析苏州市种质资源的特异性和亲缘关系,针对叶绿体基因组进行测序并进行个性化数据分析。

(二)需采购服务内容:45个样品的基因组DNA样品提取、质检、建库、测序、数据基本分析和个性化高级分析、测序质量鉴定。

(三)交付期限:合同签订后80日内完成需采购服务内容。交付方式为测序报告、原始测序数据、叶绿体基因组序列、数据分析报告。

(四)服务需满足的技术方法要求:

1、试剂盒要求:原装品牌试剂盒,非自行组配试剂。

2、建库要求: DNA片段化使用Covaris超声破碎仪进行DNA片段化,片段化的文库集中于150bp-600bp,主峰为250bp左右;构建PCR free文库;需采用Agilent2100和荧光定量PCR仪进行文库质检。

3、测序要求:使用Illumina 平台的Novaseq进行测序,测序读长为PE150,每个测序文库提供不低于5GbPF数据,Q30>85%;要求样品间混样均匀,数据量差异较小。

4、数据提交:样品检测报告;文库检测结果;测序PF data FASTQ文件,数据量和数据质量报告;全部rowdata;拼接结果;所有上述序列文件和相关分析结果文件以U盘或移动硬盘或者网络传输的方式提交,并确保提交资料符合合同约定。所有报告需加盖服务提供方公章进行确认

5、随机抽取3个样品送至第三方测序机构(华大或诺禾)进行测序,需保证第三方测序机构结果与最终交付结果一致。

6、如使用二代测序法无法获得完整叶绿体基因组数据,服务提供方需更换方案,确保获得完整准确的叶绿体基因组序列。

7、本单位从最终拼接结果中随机抽取3个样品,设计引物进行PCR扩增后进行测序,需保证测序结果与交付结果一致。

8、服务提供方需配合服务购买方进行叶绿体基因组个性化分析,必要时需配合服务购买方补充和分析必要的数据。

四、 供应商参加政府采购活动应当具备下列条件

1. 在中国境内注册,在法律上、财务上独立的机构;

2. 具有独立承担民事责任的能力;

3. 具有履行合同所必需的设备和专业技术能力;

4. 法律、行政法规规定的其他条件。

5. 资质条件:服务提供方需提供营业执照,并从事该领域工作3年以上。

6. 与服务购买方签署合同中含有保密条款,承诺不泄露相关数据。

五、 本项目不接受联合投标。

六、 本项目投标相关信息:

1. 本项目采用邮寄标书报名方式。供应商制作完成标书(三份)后邮寄至本单位。相关问题请咨询17706211727(王鹏凯)。

2. 接收标书截止时间:20191117日(以邮寄日期为准)。

3. 采购人:江苏省太湖常绿果树技术推广中心

七、 标书邮寄地址:

联系人:王鹏凯

联系电话:17706211727

邮寄地址:江苏省苏州市吴中区东山镇西泾路4号江苏省太湖常绿果树技术推广中心

八、 本招标公告的公告期限为5个工作日。

江苏省太湖常绿果树技术推广中心

二〇一九年十一月十一日

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